První litoměřické muzeum "Muzeum průmyslového spolku" vzniklo v roce 1874. Původním záměrem muzea bylo dokumentovat život a řemeslnou kulturu minulosti a shromažďovat umělecké a technické výrobky současnosti. V roce 1910 vznikla na základě původního muzea nová instituce – městské muzeum (Stadtmuseum) se sídlem ve staré renesanční radnici. V roce 1916, nedlouho před otevřením, však došlo k neštěstí, při němž se průčelí historické budovy zřítilo. Zachráněné sbírky se do radnice vrátily až po otevření opravené budovy v roce 1927. Po druhé světové válce muzeum přešlo do českých rukou, sbírky byly rozšířeny o předměty z konfiskací odsunutých německých obyvatel. Muzeum postupně převzalo i sbírky z okolních muzeí (Úštěk, Třebenice, Libochovice, Roudnice nad Labem a Lovosice, Budyně nad Ohří). V letech 1980–82 byla vybudována nová stálá expozice věnována historickému vývoji Litoměřic a Litoměřicka do roku 1945 a geologickému vývoji regionu. Od roku 2021 je muzeum uzavřeno z důvodu celkové rekonstrukce budovy a připravuje se také nová stálá expozice. Máchova světnička, která se nachází v nedalekém domě „Na Vikárce“. Muzeum své sbírky rovněž trvale zapůjčuje do expozice Muzea českého granátu v Třebenicích a do Jandova městského muzea v Budyni nad Ohří.