Non è nemmeno l'unica residenza abitata da Michelangelo in città, che furono più di una, ma qui, nel 1508, egli aveva acquisto tre piccoli appezzamenti confinanti appartenenti ai Bonsi. È incorretta la notizia che Michelangelo, all'epoca residente in Roma, non usò mai questa abitazione: era infatti presente, di ritorno da Bologna, all'atto di acquisto, ed ebbe modo di rivederla e soggiornarvi, assieme al nipote Leonardo, durante la stagione dei lavori a San Lorenzo (1516-1534). Nel 1514 la proprietà era stata ingrandita da un altro fondo confinante dell'ospedale di Santa Maria Nuova, acquistato dallo scultore.Che Michelangelo risiedesse qui lo testimoniano i documenti con cui dava a pigione le casette accessorie e, nel 1525, una delle due case principali del complesso; inoltre nella dichiarazione legata all'istituzione della decima granducale, nel 1534, Michelangelo denunciò, tra l'altro, "una casa posta in via Ghibellina, è per lo mio abitare". Dal 1539 l'edificio principale non venne più dato in pigione, anzi dal carteggio dell'artista si nota l'interesse verso una migliore sistemazione dei suoi parenti, in particolare del nipote Leonardo, figlio di suo fratello minore Buonarroto, verso cui l'artista nutriva tutte le speranze di prosecuzione della stirpe. Interessandosi al suo matrimonio con una donna del patriziato cittadino, Michelangelo suggerì prima di trovarsi una dimora più "onorevole", poi accettò di far usare i denari che egli metteva a disposizione del nipote per ristrutturare le case già in possesso.
